摘要：近年來，人類活動(dòng)影響導(dǎo)致水生態(tài)系統(tǒng)平衡遭到破壞，水生生物多樣性銳減，水生態(tài)健康狀況堪憂?？焖?、有效地監(jiān)測水生生物是評價(jià)水生態(tài)健康，科學(xué)開展水生態(tài)環(huán)境保護(hù)和管理的前提。環(huán)境DNA(environmental DNA,eDNA)技術(shù)是一種運(yùn)用分子生物學(xué)方法，從環(huán)境樣品中提取DNA并進(jìn)行測序和分析來反映物種信息的技術(shù)。由于該技術(shù)只需采集環(huán)境樣品(水、土壤、沉積物等)便能獲得大量物種信息，具有非入侵性、靈敏性及低成本等特點(diǎn)，近年來備受關(guān)注。但是，已有的研究實(shí)踐表明，目前eDNA技術(shù)仍然面臨一些挑戰(zhàn)，阻礙了其常態(tài)化、業(yè)務(wù)化應(yīng)用。從生物多樣性調(diào)查、入侵和瀕危物種監(jiān)測、食性研究等方面列舉了eDNA技術(shù)在水生生物監(jiān)測中的應(yīng)用實(shí)例，并總結(jié)目前eDNA技術(shù)在采樣效率、假陽性和假陰性、來源不確定性、數(shù)據(jù)庫缺失和定量結(jié)果不準(zhǔn)確等5個(gè)方面所面臨的問題和挑戰(zhàn)；進(jìn)一步探討研究者針對這些問題所提出的相應(yīng)解決方案和技術(shù)突破。最后，對eDNA技術(shù)未來的發(fā)展前景進(jìn)行了展望，以期為研究人員使用eDNA技術(shù)提供啟發(fā)。
